شورای عالی مالیاتی دارای هشت شعبه و هر شعبه مرکب از سه نفر عضو خواهد بود. رئیس و اعضای شعب از طرف رئیس شورای عالی مالیاتی منصوب می‌شوند. (1)
(1) به موجب تبصره 3 ماده 25 قانون مالیات بر ارزش افزوده مصوب 1400/03/02، تعداد شعب شورای عالی مالیاتی به دو برابر افزایش یافت. با توجه به افزایش تعداد شعب شورای عالی مالیاتی به شانزده شعبه، تعداد اعضای شورا به 49 نفر افزایش می یابد.