تخفیف در سامانه مودیان

با سلام و احترام اگر بنده صورتحساب رو در سامانه مودیان ارسال نمایم ولی مشتری بعد از مدتی درخواست تخفیف نمود و مدیریت با این تخفیف موافقت نمود. اولا ثبت این تخفیف در حساب تخفیفات فروش صحیح است؟ زیرا با مبلغ فروش  و فاکتورهای ارسالی همخوانی ندارد و چون تخفیف از نوع تخفیفات نقدی بوده نباید فاکتور اصلاح گردد.همچنین این تخفیف از نظر مالیاتی چگونه است؟