معافیت مالیاتی یا عدم پذیرش هزینه‌ها؛ مشروط به رعایت آیین‌نامه‌ها و دفاتر قانونی
باتوجه به نامه معاونت درآمدهای مالیاتی سازمان امور مالیاتی کشور، با عنایت به مفاد ماده (4) آیین‌نامه اجرایی بند (ب) ماده (11) قانون جهش تولید دانش‌بنیان و با استناد به مواد قانونی (147) و (148) قانون مالیات‌های مستقیم، شرایط پذیرش هزینه‌های مرتبط با تحقیق و توسعه در شرکت‌های دانش‌بنیان برای بهره‌مندی از معافیت‌های مالیاتی اعلام شد. بر اساس مفاد نامه ابلاغ‌شده، شرکت‌های دانش‌بنیان که تمایل به ثبت هزینه‌های تحقیق و توسعه خود به‌عنوان اعتبار مالیاتی دارند، ملزم به رعایت شرایط و ضوابط زیر هستند:
1. ثبت رویدادهای مالی در دفاتر قانونی: هزینه‌های مربوطه باید به‌صورت دقیق و شفاف در دفاتر روزنامه و کل، مطابق با آیین‌نامه اجرایی صدرالاشاره و با استفاده از اصول حسابداری ثبت شوند.
2. تفکیک هزینه‌های تحقیق و توسعه: هزینه‌های مرتبط (به تفکیک پروژه) باید در حساب‌های جداگانه‌ای در دفاتر ثبت‌شده و مشخص باشند تا امکان بررسی دقیق آن‌ها فراهم باشد.
3. انجام هزینه‌ها در راستای مفاد مواد 147 و 148 قانون مالیات‌های مستقیم
همچنین، براساس قوانین مرتبط، مودیانی که معاملات و رویدادهای مالی خود را در دفاتر روزنامه و کل به‌صورت ماهانه ثبت می‌کنند، ملزم هستند هزینه‌های تحقیق و توسعه را بر اساس طرح (پروژه) به تفکیک و با جزئیات در دفاتر معین (دستی یا ماشینی) ثبت کنند. این تفکیک و نگهداری حساب‌های مجزا به هیچ عنوان مانع پذیرش این هزینه‌ها به‌عنوان اعتبار مالیاتی نخواهد بود و این هزینه‌ها طبق مقررات مذکور همچنان قابل بهره‌برداری هستند.
