خرید از اشخاص حقیقی که هنوز عضو سامانه مودیان نشدند

سلام. شرکتی در زمینه تعمیرات فعالیت میکند و خریدهایش رو از اشخاص انجام میده که اونا هم در سامانه ثبت نمی کنن اما فروش ها به ادارات انجام میشه و ازشون ارزش افزوده دریافت میشه. با توجه به اینکه خریدهامون ثبت نمیشه بعدها در رسیدگی به مشکل نمیخوریم؟ راه کار چیه؟