مالیات حقوق در شعب زیرمجموعه

سلام وقت بخير بنده يک شرکت پيمانکاري خصوصي دارم که امسال و طي شهريور ماه جاري موفق به گرفتن دو فقره قرارداد با دو شرکت بزرگ شدم،از ابتداي سال جاري تاکنون يک قرارداد فعال از قبل با يکي از اين دو شرکت ها داشتم يعني در يکي از شرکت ها دو فقره قرارداد و در يکي ديگر يک فقره قرارداد،حالا سوال بنده اينست براي ارسال ليست حقوق و دستمزد پرسنل هر قرارداد و بمنظور پرداخت ماليات حقوق پرسنل هر قرارداد چگونه اقدام کنم؟یعني مثلا در شهريور ليست اولين قرارداد گزينه اصلي را انتخاب کنم و براي دو ليست ديگر از گزينه الحاقي يا اصلاحي استفاده کنم.